Зачет НДС с авансов

Уважаемые коллеги, очень нужно ваше мнение. Подписан долгосрочный договор строительного подряда, на год, мы выступаем в качестве подрядчика. По договору нами получен аванс от заказчика в размере 36,97% от суммы договора. По договору следует, что расчет за выполненные объемы работ производится ежемесячно с зачетом выплаченного аванса в размере 36,97% от объема выполненных подрядчиком работ на основании подписанных КС-2, КС-3. НДС с полученного аванса мы заплатили, теперь после подписания актов выполненных работ ежемесячно проводим зачет НДС с аванса также в размере 36,97%. Далее было подписано Дополнительное соглашение к этому основному договору на дополнительные работы, по которому мы также получили аванс, только в размере 44%. О расчетах в доп.соглашении ничего не сказано. Возник вопрос в какой сумме теперь принимать к вычету НДС по доп.соглашению? Руководствоваться основным договором и также проводить зачет в размере 36,97% или пропорционально полученному авансу?